研究方向：油菜重要经济性状功能分子标记研发及其育种应用；控制油菜含油量和产量性状关键基因的分离、克隆和功能验证；油菜广亲和核不育基因的连锁标记筛选、精细定位和杂交种选育；甘兰型油菜核心种质构建

目前主持的在研项目有：国家自然科学基金项目“目标QTL区间菜籽油分和粒重相关基因克隆及相互关系研究”（8万，2008）；以学术骨干进入国家“973”项目“油菜籽油脂形成的分子生物学机制及其代谢调控”研究团队（90万，2006-2011）；主持国家“863”项目子课题“优质高产多抗油菜和花生分子与细胞品种创制”（22万，2007-2010）；主持浙江省科技攻关计划面上项目“影响油菜籽油分含量关键基因的发掘和利用研究”（24万，2007-2009）；浙江省财政专项资助与中科院遗传发育研究所合作项目“油菜细胞核雄性不育三系模式的生物学研究和基因克隆”（25万，2007-2009）等多项课题。

以主要完成人育成双低油菜品种7个，2002年获浙江省科技进步一等奖1项（第二）

近三年来发表的主要论文：

1)      Zhao, J.-Y., etc., 2008, Mapping QTL controlling fatty acid composition in a doubled haploid rapeseed population segregating for oil content. Mol. Breeding 21:115-125

2)      Zhao, J.-Y., etc., 2007, Oil content related candidate gene mapping in oilseed rape, 12th International Rapeseed Congress, Proceedings Vol.Ⅱ, 253-256 (分会报告,2007年3月26-29日在武汉举行)

3)      Zhao, J.-Y., etc., 2006, Conditional QTL mapping of oil content in rapeseed with respect to protein content and traits related to plant development

and grain yield, Theor. Appl. Genet., 113:33-38

4)      Zhao, J.-Y., etc, 2005, Oil content in a European Chinese Rapeseed Population : QTL with additive and epistatic effects and their genotype-environment interactions, Crop Sci., 45:51-59

5）Zhao, J.-Y., etc, 2005, QTL of three agronomically important traits and their interactions with environment in a European ×Chinese rapeseed population. Acta Genetica Sinica, China, 32: 969-978 (遗传学报英文版)